R/functions.R
perm.cor.mtest.Rd
Test par permutation d'une matrice de corrélations de Bravais-Pearson
perm.cor.mtest( mat, alternative = "two.sided", method = "pearson", num.sim = 20000, ... )
mat | Matrice des données |
---|---|
alternative | Type d'hypothèses bilatéral, unilatéral inférieur ou supérieur |
method | Méthode de calcul de corrélation Pearson ou Spearman |
num.sim | Nombre de simulations |
... | Paramètre suplémentaires transmis à la fonction cor |
Liste de deux éléments : matrice p.mat (matrice des p-valeurs des tests) et matrice cor.mat (matrice des valeurs observées des coefficients de corrélation de Bravais-Pearson)
data(Mesures5,package="BioStatR") Mes5_red_gv = subset(Mesures5[,-5],subset=Mesures5$espece=="glycine violette") perm.cor.mtest(Mes5_red_gv,num.sim=100)#> $p #> [,1] [,2] [,3] [,4] #> [1,] 0 0 0 0 #> [2,] 0 0 0 0 #> [3,] 0 0 0 0 #> [4,] 0 0 0 0 #> #> $cor #> [,1] [,2] [,3] [,4] #> [1,] 1.0000000 0.9766664 0.8192745 0.9835545 #> [2,] 0.9766664 1.0000000 0.8191560 0.9617112 #> [3,] 0.8192745 0.8191560 1.0000000 0.8325095 #> [4,] 0.9835545 0.9617112 0.8325095 1.0000000 #>