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Test par permutation d'une matrice de corrélations de Bravais-Pearson

Usage

perm.cor.mtest(
  mat,
  alternative = "two.sided",
  method = "pearson",
  num.sim = 20000,
  ...
)

Arguments

mat

Matrice des données

alternative

Type d'hypothèses bilatéral, unilatéral inférieur ou supérieur

method

Méthode de calcul de corrélation Pearson ou Spearman

num.sim

Nombre de simulations

...

Paramètre suplémentaires transmis à la fonction cor

Value

Liste de deux éléments : matrice p.mat (matrice des p-valeurs des tests) et matrice cor.mat (matrice des valeurs observées des coefficients de corrélation de Bravais-Pearson)

Examples

data(Mesures5,package="BioStatR")
Mes5_red_gv = subset(Mesures5[,-5],subset=Mesures5$espece=="glycine violette")
perm.cor.mtest(Mes5_red_gv,num.sim=100)
#> $p
#>      [,1] [,2] [,3] [,4]
#> [1,]    0    0    0    0
#> [2,]    0    0    0    0
#> [3,]    0    0    0    0
#> [4,]    0    0    0    0
#> 
#> $cor
#>           [,1]      [,2]      [,3]      [,4]
#> [1,] 1.0000000 0.9766664 0.8192745 0.9835545
#> [2,] 0.9766664 1.0000000 0.8191560 0.9617112
#> [3,] 0.8192745 0.8191560 1.0000000 0.8325095
#> [4,] 0.9835545 0.9617112 0.8325095 1.0000000
#>