A precomputed bootstrap distribution of the coefficients of a model used in the vignette.

TxTum.mod.bootBR6

Format

a class boot object

References

Régression Bêta PLS. (French) [PLS Beta regression.], F. Bertrand, N. Meyer, M. Beau-Faller, K. El Bayed, N. Izzie-J., M. Maumy-Bertrand, (2013), J. SFdS, 154(3):143-159

Partial Least Squares Regression for Beta Regression Models. F. Bertrand, M. Maumy (2021). useR! 2021, Zurich.

Examples


data(TxTum.mod.bootBR6)
str(TxTum.mod.bootBR6)
#> List of 11
#>  $ t0       : num [1:60, 1] 0.0864 0.0684 0.0444 0.06 0.0132 ...
#>   ..- attr(*, "dimnames")=List of 2
#>   .. ..$ : chr [1:60] "Intercept" "age" "sexe" "HISTOADK" ...
#>   .. ..$ : NULL
#>  $ t        : num [1:1000, 1:60] 0.3376 0.1388 0.017 -0.0992 0.0294 ...
#>  $ R        : int 1000
#>  $ data     :'data.frame':	106 obs. of  60 variables:
#>   ..$ y       : 'AsIs' Named num [1:106]  0.8 0.99  0.2  0.9  0.5  0.8  0.4  0.7  0.6  0.9 ...
#>   .. ..- attr(*, "names")= chr [1:106] "1" "2" "3" "4" ...
#>   ..$ age     : num [1:106] 59 67 60 65 43 67 53 66 71 65 ...
#>   ..$ sexe    : num [1:106] 1 1 1 1 1 0 1 1 1 1 ...
#>   ..$ HISTOADK: num [1:106] 1 1 0 1 1 1 1 0 1 1 ...
#>   ..$ H2      : num [1:106] NA 1 0 1 1 1 1 0 1 1 ...
#>   ..$ P3      : num [1:106] 1 1 1 1 1 NA 1 0 1 1 ...
#>   ..$ P4      : num [1:106] NA 1 0 1 1 NA 0 0 1 1 ...
#>   ..$ E1      : num [1:106] 1 1 0 1 NA NA 1 1 NA 1 ...
#>   ..$ P5      : num [1:106] NA 1 NA 0 NA 0 1 1 NA 0 ...
#>   ..$ R10     : num [1:106] 1 1 1 NA NA 1 1 NA 1 1 ...
#>   ..$ C3M     : num [1:106] 1 NA NA 0 1 1 1 1 1 1 ...
#>   ..$ P6      : num [1:106] 1 1 0 0 0 NA 0 NA 1 1 ...
#>   ..$ RB      : num [1:106] NA 1 0 0 0 1 1 1 1 1 ...
#>   ..$ FL7A    : num [1:106] 1 0 0 1 NA 1 1 1 NA 1 ...
#>   ..$ P53     : num [1:106] NA 1 1 1 1 1 0 1 1 1 ...
#>   ..$ W2      : num [1:106] 1 0 0 1 1 0 0 1 NA 1 ...
#>   ..$ P2      : num [1:106] 1 0 0 0 1 0 0 1 1 1 ...
#>   ..$ P1      : num [1:106] 0 0 0 0 0 0 NA 0 1 1 ...
#>   ..$ W4      : num [1:106] 0 NA 0 NA 0 NA 0 0 NA 1 ...
#>   ..$ MT1     : num [1:106] NA 1 0 NA 0 NA NA 1 NA 0 ...
#>   ..$ MT2     : num [1:106] 0 NA 0 NA NA 1 1 1 1 0 ...
#>   ..$ MT4     : num [1:106] 0 1 0 0 0 1 1 1 1 0 ...
#>   ..$ MT3     : num [1:106] 1 1 NA 0 NA NA 0 NA 1 NA ...
#>   ..$ HLA     : num [1:106] NA 1 0 0 0 1 1 NA 0 0 ...
#>   ..$ HLD     : num [1:106] 0 1 0 0 0 1 1 1 NA NA ...
#>   ..$ HLC     : num [1:106] 0 1 0 0 NA 1 1 NA NA NA ...
#>   ..$ HLB     : num [1:106] 0 1 NA NA NA 1 1 1 NA 0 ...
#>   ..$ EA1     : num [1:106] 1 0 NA 0 0 NA 0 1 1 1 ...
#>   ..$ EA3     : num [1:106] 1 0 NA NA 0 0 0 1 1 NA ...
#>   ..$ EA2     : num [1:106] 1 NA 0 NA 0 NA 0 1 1 1 ...
#>   ..$ EA4     : num [1:106] 1 0 0 0 NA NA NA 1 1 1 ...
#>   ..$ EB1     : num [1:106] NA NA 1 0 0 NA 1 NA NA NA ...
#>   ..$ EB2     : num [1:106] 1 NA 1 0 0 NA NA 1 1 0 ...
#>   ..$ EB3     : num [1:106] 1 NA NA 0 0 0 1 1 1 0 ...
#>   ..$ EB4     : num [1:106] 1 1 1 0 NA 1 NA 1 NA 0 ...
#>   ..$ EGF1    : num [1:106] 1 1 NA NA NA NA 1 NA NA 1 ...
#>   ..$ EGF2    : num [1:106] 1 1 0 NA 0 1 1 NA 0 1 ...
#>   ..$ EGF3    : num [1:106] NA 1 0 NA 0 1 NA 1 0 NA ...
#>   ..$ EGF4    : num [1:106] 1 1 0 1 NA NA 1 1 0 1 ...
#>   ..$ EGF5    : num [1:106] 1 NA 0 NA NA NA 1 1 0 1 ...
#>   ..$ EGF6    : num [1:106] 1 NA 0 NA NA NA 1 NA 0 1 ...
#>   ..$ FL7B    : num [1:106] NA 0 NA 1 0 0 1 NA 1 1 ...
#>   ..$ VSFGF7  : num [1:106] 1 0 0 1 0 1 1 1 1 1 ...
#>   ..$ F3A     : num [1:106] 1 NA 0 1 0 1 NA NA NA 1 ...
#>   ..$ F3B     : num [1:106] 1 1 0 NA 0 NA NA 1 1 1 ...
#>   ..$ VSFGFR3 : num [1:106] 1 1 0 1 0 1 NA 1 1 1 ...
#>   ..$ F4      : num [1:106] 0 0 NA NA NA 0 0 0 NA 1 ...
#>   ..$ Q5      : num [1:106] 0 0 0 0 0 0 0 NA 1 NA ...
#>   ..$ VSTOP1  : num [1:106] 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 ...
#>   ..$ VSTOP2A : num [1:106] 1 0 0 0 1 0 0 1 1 1 ...
#>   ..$ VSEGFR  : num [1:106] 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 ...
#>   ..$ AFRAEGFR: num [1:106] 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 ...
#>   ..$ SRXRA   : num [1:106] 1 1 0 0 1 1 1 1 1 1 ...
#>   ..$ SMT     : num [1:106] 0 1 0 0 0 1 1 1 1 0 ...
#>   ..$ QMTAMPN : num [1:106] 0 NA 0 0 0 NA 1 1 NA 0 ...
#>   ..$ QMTDELN : num [1:106] 0 1 0 0 0 1 NA NA 1 0 ...
#>   ..$ SHL     : num [1:106] 0 1 0 0 0 1 1 1 0 0 ...
#>   ..$ SEA     : num [1:106] 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 ...
#>   ..$ SEB     : num [1:106] 1 1 1 0 0 0 1 1 1 0 ...
#>   ..$ QPCRFGF7: num [1:106] 0 1 1 0 1 1 1 0 0 1 ...
#>  $ seed     : int [1:626] 403 1 314465632 1285575422 1728335497 -1283032645 -934780022 -1885713812 1340376047 -1981797339 ...
#>  $ statistic:function (dataset, ind, nt, modele, family = NULL, method = "logistic", 
#>     link = NULL, link.phi = NULL, type = "ML")  
#>  $ sim      : chr "ordinary"
#>  $ call     : language boot(data = dataset, statistic = coefs.plsRbeta, R = 1000L, sim = sim,      stype = stype, nt = nt, modele = mode| __truncated__ ...
#>  $ stype    : chr "i"
#>  $ strata   : num [1:106] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
#>  $ weights  : num [1:106] 0.00943 0.00943 0.00943 0.00943 0.00943 ...
#>  - attr(*, "class")= chr "boot"
plot(TxTum.mod.bootBR6)